A Comissão Jurídica Independente, um órgão dentro da APAF, enviou várias queixas ao Conselho de Disciplina da FPF relacionadas com o FC Porto, incluindo uma que envolve todo o plantel. Essas queixas surgiram após os jogadores dos dragões terem partilhado um comunicado conjunto criticando a arbitragem depois da derrota contra o Estoril.

Uma das queixas disciplinares enviadas ao Conselho de Disciplina é dirigida a Sérgio Conceição, relacionada com a conferência de imprensa do treinador antes do jogo em Guimarães para a Taça de Portugal, onde criticou as arbitragens ao longo da temporada.

Além disso, no documento divulgado pela Comissão de Análise Jurídica Independente, há uma queixa envolvendo Pinto da Costa, que já havia sido reportada anteriormente. O motivo são as declarações do presidente do FC Porto após o jogo com o Estoril, na conferência de imprensa na Amoreira, e também numa recente entrevista à SIC.